Et si l’IA pouvait parler aux protéines ? Vous savez, ces grosses molécules complexes qui jouent de nombreux rôles essentiels dans l’organisme ? Accrochez-vous à vos blouses de laboratoire, car Ankh, un nouveau modèle de langage protéique, se propose de le faire.
Ankh a été créé par un groupe d’experts des universités de Munich et de Columbia, en collaboration avec la société de biotechnologie Protinea. Le nom vient d’un ancien symbole égyptien représentant la vie, ce qui convient parfaitement à un modèle de langage d’IA qui se penche sur les éléments constitutifs de la vie.
Selon un document de recherche, Ankh apprend le « langage des protéines » en analysant un vaste ensemble de données de séquences de protéines, puis utilise ces connaissances pour créer de nouvelles séquences de protéines et tenter de déterminer comment elles pourraient fonctionner.
Un modèle de langage protéique comme Ankh et un grand modèle de langage comme ChatGPT sont similaires. Dans les protéines, l’alphabet est constitué d’acides aminés. Ces acides aminés s’associent pour former des chaînes, un peu comme des mots. La séquence des acides aminés doit être dans un ordre spécifique pour que la protéine se plie dans la forme 3D correcte, ce qui est essentiel pour sa fonction. En gros, c’est comme la façon dont les gens assemblent les mots dans une langue spécifique, en suivant un ensemble de règles afin de communiquer correctement.
Un Grand Modèle de Langage fonctionne en essayant de prédire quel mot aurait le plus de sens dans un résultat spécifique en fonction d’une invite, et Ankh essaie essentiellement de faire la même chose, en devinant quelle configuration biologique aurait le plus de sens pour un résultat spécifique en tenant compte de tout ce que nous savons sur les protéines et leurs règles structurelles.
La compréhension des protéines (et de leur langage) est cruciale pour la biologie humaine. Elles jouent un rôle clé dans la structure, la fonction et la régulation des tissus et des organes du corps humain.
La capacité d’Ankh à analyser et à prédire le comportement des protéines pourrait s’avérer extrêmement utile dans les domaines de la médecine, des sciences de l’environnement, etc. Par exemple, dans le domaine de la découverte de médicaments, Ankh pourrait être utilisé pour prédire comment les protéines interagissent avec divers composés, ce qui pourrait accélérer considérablement le développement de nouveaux médicaments.
En outre, elle peut aider les scientifiques à comprendre comment les mutations dans les protéines peuvent entraîner des maladies, ce qui est inestimable pour la recherche génétique.
Au-delà de la médecine, Ankh a des applications en biologie synthétique, où il peut être utilisé pour concevoir de nouvelles protéines qui présentent les fonctions souhaitées. Les implications sont considérables pour des domaines tels que les énergies renouvelables et la science des matériaux. En concevant des protéines capables, par exemple, de décomposer les plastiques ou de produire des biocarburants plus efficacement, Ankh peut contribuer à résoudre certains des défis environnementaux les plus pressants de notre époque.
Utilisations d’Ankh. Image : Arvix.org
Comme l’a récemment rapporté TCN, OpenAI – le géant de l’IA connu pour avoir développé le générateur d’images Stable Diffusion – n’est pas étranger au monde des protéines. L’entreprise s’est également intéressée à l’IA pour la recherche sur les protéines. Avec l’arrivée d’Ankh sur la scène, il semble que l’IA réchauffe le domaine de la recherche, rendant les protéines aussi intéressantes qu’elles peuvent l’être.
Ankh est accessible au public et distribué sous licence CC BY-NC-SA 4.0, donc si vous voulez parler à vos protéines, n’hésitez pas.
Quelle est la prochaine étape pour Ankh ? Les chercheurs restent discrets, mais on peut s’attendre à un développement rapide de nouvelles fonctionnalités et améliorations. Quant à Chaos-GPT, l’IA qui veut dominer le monde ? Elle pourrait envisager de faire équipe avec Ankh. Car, soyons réalistes : les protéines dominent le monde.
